30个专业委员会：军事系统工程专业委员会、系统理论专业委员会、社会经济系统工程专业委员会、模糊数学与模糊系统专业委员会、农业系统工程专业委员会、教育系统工程专业委员会、信息系统工程专业委员会、科技系统工程专业委员会、交通运输系统工程专业委员会、过程系统工程专业委员会、决策科学专业委员会、人-机-环境系统工程专业委员会、林业系统工程专业委员会、草业系统工程专业委员会、系统动力学专业委员会、医疗卫生系统工程专业委员会、金融系统工程专业委员会、船舶和海洋系统工程专业委员会、能源资源系统工程分会、服务系统工程分会、物流系统工程专业委员会、水利系统工程专业委员会和应急管理系统工程专业委员会、港航经济系统工程专业委员会、可持续运营与管理系统分会、系统可靠性工程专业委员会、智能制造系统工程专业委员会、生态环境系统工程专业委员会、数据科学与知识系统专业委员会、创业创新系统工程专业委员会。

6个工作委员会：学术工作委员会、国际学术交流工作委员会、教育与普及工作委员会、编辑出版工作委员会、青年工作委员会、应用与咨询工作委员会。

              专 业 委 员 会

业委员会编码及名称	成立 年份	分管领导	负责人	联络人/秘书长
01  系统理论	1980	汪小帆	樊瑛	张鹏
02  军事系统工程	1980	杨克巍	李 辉	李宁
03  社会经济系统	1982	闫相斌	娄峰	程远
04  模糊数学与模糊系统 工程	1983	寇纲	赵彬	寇辉
05  决策科学	1992	胡祥培	庞庆华	张丽娜
06  信息系统工程	1987	闫相斌	徐心	肖勇波
07  过程系统工程	1991	胡祥培	王子宗	姜晓阳
08  人-机-环境系统工程	1987	闫相斌	刘皓珽	刘皓珽
09  系统动力学	1992	范英	钟永光	钟永光
10  教育系统工程	1987	丁晓东	刘金兰	何建佳
11  科技系统工程	1987	寇纲	钱仲炎	张昭
12  交通运输系统工程	1989	冯耕中	毛保华	毛保华
13  农业系统工程	1984	冯耕中	李炳军	陈赓
14  林业系统工程	1987	范英	雷相东	孙华
15  草业系统工程	1990	范英	牛得草	王增如
16  医药卫生系统工程	1993	李仲飞	李康	张向红
17  金融系统工程	2014	李仲飞	张维	冯绪
18  船舶和海洋系统工程	2015	寇纲	赵金楼	赵恩娇
19  能源资源系统工程	2015	范英	范英	赵晓丽
20  服务系统工程	2015	刘心报	吴德胜	吴德胜
21  物流系统工程	2015	胡祥培	胡祥培	王海燕
22 水利系统工程	2016	李仲飞	王慧敏	王慧敏
23  应急管理系统工程	2016	冯耕中	赵秋红	秦中峰
24  港航经济系统工程	2017	李仲飞	匡海波	孟斌
25  可持续运营与管理系统	2017	寇纲	朱庆华	王能民
26  系统可靠性工程	2017	汪小帆	朱晓燕	朱晓燕
27 智能制造系统工程	2017	刘心报	刘心报	刘心报
28 生态环境系统工程专业委员会	2020	范英	陈彬	房德琳
29 数据科学与知识系统工程专业委员会	2020	寇纲	党延忠	杨光飞
30 创业创新系统工程专委会	2024	汪寿阳	周小宇	周小宇

      工 作 委 员 会

工作委员会编码及名称	成立年份	分管领导	分管副秘书长
01  学术工作委员会	1980	汪小帆	丁义明
02  国际学术交流工作委员会	1980	唐锡晋	肖永波
03  教育与普及工作委员会	1981	杨克巍	曹志刚
04  编辑出版工作委员会	1980	杨晓光	李琳
05  青年工作委员会	1992	冯耕中	李金
06  应用咨询工作委员会	2011	杨晓光	郑新华